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技术派:寡核苷酸药物合成及其杂质分析

目前寡核酸药物大多通过固相亚磷酰胺化学法进行合成。化学合成按照3'-5'的方向进行。

常用的固相载体为可控微孔玻璃珠(CPG),CPG通过linker与初始核苷酸核糖的3'-OH共价结合,而核糖的2'-OH用诸如叔丁基二甲基硅基(TBDMS)的保护试剂进行保护,5'-OH则用双甲氧基三苯甲基(DMT)保护。此外,由于腺嘌呤、鸟嘌呤和胞嘧啶存在伯氨基团,也需要用酰基试剂(例如苯甲酰基)进行保护。


固相合成每个循环主要包括四个步骤:去保护、偶联、氧化和加帽。合成中产生的杂质(包括最后的脱保护)有以下几种类型:

截短的序列(shortmer sequences)N-X,如N-1,N-2;

更长的序列(longmer sequences)N+X,如N+G,N+A;

硫代磷酸酯键(PS)产生的非对映异构体和氧化产生PO杂质;

胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶脱氨基引起的杂质;

其他杂质,如碱基脱嘌呤杂质、2'-5'连接异构杂质、序列异构体等;


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